Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE2

Trem1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem1Q9JKE2 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trem1Q9JKE2 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trem1Q9JKE2 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trem1Q9JKE2 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trem1Q9JKE2 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trem1Q9JKE2 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trem1Q9JKE2 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trem1Q9JKE2 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trem1Q9JKE2 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trem1Q9JKE2 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Trem1Q9JKE2 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trem1Q9JKE2 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trem1Q9JKE2 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trem1Q9JKE2 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trem1Q9JKE2 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trem1Q9JKE2 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trem1Q9JKE2 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trem1Q9JKE2 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trem1Q9JKE2 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trem1Q9JKE2 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trem1Q9JKE2 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Trem1Q9JKE2 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trem1Q9JKE2 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trem1Q9JKE2 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trem1Q9JKE2 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trem1Q9JKE2 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trem1Q9JKE2 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Trem1Q9JKE2 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trem1Q9JKE2 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Trem1Q9JKE2 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Trem1Q9JKE2 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trem1Q9JKE2 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trem1Q9JKE2 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trem1Q9JKE2 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trem1Q9JKE2 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trem1Q9JKE2 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trem1Q9JKE2 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trem1Q9JKE2 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trem1Q9JKE2 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trem1Q9JKE2 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trem1Q9JKE2 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trem1Q9JKE2 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trem1Q9JKE2 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trem1Q9JKE2 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trem1Q9JKE2 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trem1Q9JKE2 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trem1Q9JKE2 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trem1Q9JKE2 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trem1Q9JKE2 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trem1Q9JKE2 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Trem1Q9JKE2 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trem1Q9JKE2 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trem1Q9JKE2 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trem1Q9JKE2 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trem1Q9JKE2 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trem1Q9JKE2 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trem1Q9JKE2 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trem1Q9JKE2 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Trem1Q9JKE2 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trem1Q9JKE2 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trem1Q9JKE2 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trem1Q9JKE2 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trem1Q9JKE2 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Trem1Q9JKE2 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trem1Q9JKE2 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trem1Q9JKE2 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trem1Q9JKE2 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trem1Q9JKE2 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trem1Q9JKE2 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trem1Q9JKE2 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trem1Q9JKE2 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trem1Q9JKE2 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trem1Q9JKE2 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trem1Q9JKE2 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trem1Q9JKE2 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trem1Q9JKE2 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trem1Q9JKE2 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trem1Q9JKE2 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trem1Q9JKE2 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trem1Q9JKE2 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Trem1Q9JKE2 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Trem1Q9JKE2 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trem1Q9JKE2 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trem1Q9JKE2 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trem1Q9JKE2 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trem1Q9JKE2 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trem1Q9JKE2 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trem1Q9JKE2 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trem1Q9JKE2 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trem1Q9JKE2 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trem1Q9JKE2 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trem1Q9JKE2 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trem1Q9JKE2 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trem1Q9JKE2 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trem1Q9JKE2 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trem1Q9JKE2 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trem1Q9JKE2 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trem1Q9JKE2 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trem1Q9JKE2 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trem1Q9JKE2 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms