Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB1

Uchl3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl3Q9JKB1 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Uchl3Q9JKB1 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Uchl3Q9JKB1 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Uchl3Q9JKB1 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Uchl3Q9JKB1 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Uchl3Q9JKB1 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Uchl3Q9JKB1 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Uchl3Q9JKB1 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Uchl3Q9JKB1 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Uchl3Q9JKB1 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Uchl3Q9JKB1 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Uchl3Q9JKB1 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Uchl3Q9JKB1 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Uchl3Q9JKB1 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Uchl3Q9JKB1 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Uchl3Q9JKB1 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Uchl3Q9JKB1 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Uchl3Q9JKB1 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Uchl3Q9JKB1 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Uchl3Q9JKB1 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Uchl3Q9JKB1 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Uchl3Q9JKB1 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Uchl3Q9JKB1 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Uchl3Q9JKB1 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Uchl3Q9JKB1 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Uchl3Q9JKB1 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Uchl3Q9JKB1 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Uchl3Q9JKB1 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Uchl3Q9JKB1 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Uchl3Q9JKB1 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Uchl3Q9JKB1 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Uchl3Q9JKB1 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Uchl3Q9JKB1 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Uchl3Q9JKB1 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Uchl3Q9JKB1 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Uchl3Q9JKB1 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Uchl3Q9JKB1 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Uchl3Q9JKB1 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Uchl3Q9JKB1 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Uchl3Q9JKB1 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Uchl3Q9JKB1 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Uchl3Q9JKB1 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Uchl3Q9JKB1 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Uchl3Q9JKB1 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Uchl3Q9JKB1 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Uchl3Q9JKB1 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Uchl3Q9JKB1 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Uchl3Q9JKB1 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Uchl3Q9JKB1 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Uchl3Q9JKB1 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Uchl3Q9JKB1 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Uchl3Q9JKB1 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Uchl3Q9JKB1 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Uchl3Q9JKB1 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Uchl3Q9JKB1 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Uchl3Q9JKB1 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Uchl3Q9JKB1 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Uchl3Q9JKB1 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Uchl3Q9JKB1 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Uchl3Q9JKB1 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Uchl3Q9JKB1 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Uchl3Q9JKB1 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Uchl3Q9JKB1 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Uchl3Q9JKB1 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Uchl3Q9JKB1 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Uchl3Q9JKB1 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Uchl3Q9JKB1 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Uchl3Q9JKB1 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Uchl3Q9JKB1 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Uchl3Q9JKB1 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Uchl3Q9JKB1 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Uchl3Q9JKB1 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Uchl3Q9JKB1 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Uchl3Q9JKB1 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Uchl3Q9JKB1 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Uchl3Q9JKB1 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Uchl3Q9JKB1 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Uchl3Q9JKB1 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Uchl3Q9JKB1 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Uchl3Q9JKB1 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Uchl3Q9JKB1 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Uchl3Q9JKB1 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Uchl3Q9JKB1 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Uchl3Q9JKB1 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Uchl3Q9JKB1 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Uchl3Q9JKB1 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Uchl3Q9JKB1 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Uchl3Q9JKB1 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Uchl3Q9JKB1 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Uchl3Q9JKB1 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Uchl3Q9JKB1 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Uchl3Q9JKB1 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Uchl3Q9JKB1 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Uchl3Q9JKB1 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Uchl3Q9JKB1 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Uchl3Q9JKB1 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Uchl3Q9JKB1 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Uchl3Q9JKB1 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Uchl3Q9JKB1 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Uchl3Q9JKB1 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms