Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ8

Cnga3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga3Q9JJZ8 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnga3Q9JJZ8 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnga3Q9JJZ8 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnga3Q9JJZ8 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnga3Q9JJZ8 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnga3Q9JJZ8 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnga3Q9JJZ8 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnga3Q9JJZ8 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnga3Q9JJZ8 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnga3Q9JJZ8 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnga3Q9JJZ8 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnga3Q9JJZ8 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnga3Q9JJZ8 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnga3Q9JJZ8 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnga3Q9JJZ8 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnga3Q9JJZ8 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnga3Q9JJZ8 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnga3Q9JJZ8 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnga3Q9JJZ8 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnga3Q9JJZ8 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnga3Q9JJZ8 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnga3Q9JJZ8 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnga3Q9JJZ8 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnga3Q9JJZ8 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnga3Q9JJZ8 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnga3Q9JJZ8 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnga3Q9JJZ8 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnga3Q9JJZ8 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnga3Q9JJZ8 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnga3Q9JJZ8 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnga3Q9JJZ8 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnga3Q9JJZ8 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnga3Q9JJZ8 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnga3Q9JJZ8 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnga3Q9JJZ8 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnga3Q9JJZ8 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnga3Q9JJZ8 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnga3Q9JJZ8 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnga3Q9JJZ8 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnga3Q9JJZ8 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnga3Q9JJZ8 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnga3Q9JJZ8 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnga3Q9JJZ8 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnga3Q9JJZ8 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnga3Q9JJZ8 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnga3Q9JJZ8 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnga3Q9JJZ8 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnga3Q9JJZ8 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnga3Q9JJZ8 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnga3Q9JJZ8 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cnga3Q9JJZ8 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cnga3Q9JJZ8 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cnga3Q9JJZ8 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cnga3Q9JJZ8 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cnga3Q9JJZ8 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cnga3Q9JJZ8 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms