Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJQ0

Pigb, GPI mannosyltransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PigbQ9JJQ0 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PigbQ9JJQ0 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PigbQ9JJQ0 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PigbQ9JJQ0 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PigbQ9JJQ0 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PigbQ9JJQ0 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PigbQ9JJQ0 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PigbQ9JJQ0 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PigbQ9JJQ0 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PigbQ9JJQ0 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PigbQ9JJQ0 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PigbQ9JJQ0 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PigbQ9JJQ0 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PigbQ9JJQ0 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PigbQ9JJQ0 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PigbQ9JJQ0 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PigbQ9JJQ0 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PigbQ9JJQ0 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PigbQ9JJQ0 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PigbQ9JJQ0 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PigbQ9JJQ0 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PigbQ9JJQ0 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PigbQ9JJQ0 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PigbQ9JJQ0 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PigbQ9JJQ0 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PigbQ9JJQ0 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PigbQ9JJQ0 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PigbQ9JJQ0 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PigbQ9JJQ0 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PigbQ9JJQ0 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PigbQ9JJQ0 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PigbQ9JJQ0 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PigbQ9JJQ0 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PigbQ9JJQ0 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PigbQ9JJQ0 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PigbQ9JJQ0 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PigbQ9JJQ0 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PigbQ9JJQ0 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PigbQ9JJQ0 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PigbQ9JJQ0 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PigbQ9JJQ0 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PigbQ9JJQ0 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PigbQ9JJQ0 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PigbQ9JJQ0 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PigbQ9JJQ0 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PigbQ9JJQ0 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PigbQ9JJQ0 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PigbQ9JJQ0 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PigbQ9JJQ0 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PigbQ9JJQ0 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PigbQ9JJQ0 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PigbQ9JJQ0 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PigbQ9JJQ0 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PigbQ9JJQ0 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PigbQ9JJQ0 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PigbQ9JJQ0 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PigbQ9JJQ0 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PigbQ9JJQ0 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PigbQ9JJQ0 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PigbQ9JJQ0 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PigbQ9JJQ0 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PigbQ9JJQ0 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PigbQ9JJQ0 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PigbQ9JJQ0 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PigbQ9JJQ0 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PigbQ9JJQ0 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PigbQ9JJQ0 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PigbQ9JJQ0 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PigbQ9JJQ0 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PigbQ9JJQ0 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PigbQ9JJQ0 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PigbQ9JJQ0 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PigbQ9JJQ0 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PigbQ9JJQ0 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PigbQ9JJQ0 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PigbQ9JJQ0 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PigbQ9JJQ0 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PigbQ9JJQ0 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PigbQ9JJQ0 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PigbQ9JJQ0 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PigbQ9JJQ0 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PigbQ9JJQ0 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PigbQ9JJQ0 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PigbQ9JJQ0 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PigbQ9JJQ0 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PigbQ9JJQ0 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PigbQ9JJQ0 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PigbQ9JJQ0 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PigbQ9JJQ0 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PigbQ9JJQ0 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PigbQ9JJQ0 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PigbQ9JJQ0 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PigbQ9JJQ0 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PigbQ9JJQ0 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PigbQ9JJQ0 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PigbQ9JJQ0 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PigbQ9JJQ0 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PigbQ9JJQ0 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PigbQ9JJQ0 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PigbQ9JJQ0 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms