Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ80

Rpf2, Ribosome production factor 2 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpf2Q9JJ80 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpf2Q9JJ80 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms