Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lmbr1Q9JIT0 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms