Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI70

Mkks, McKusick-Kaufman/Bardet-Biedl syndromes putative chaperonin, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MkksQ9JI70 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MkksQ9JI70 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MkksQ9JI70 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MkksQ9JI70 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MkksQ9JI70 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MkksQ9JI70 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MkksQ9JI70 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MkksQ9JI70 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MkksQ9JI70 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MkksQ9JI70 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MkksQ9JI70 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MkksQ9JI70 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MkksQ9JI70 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MkksQ9JI70 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MkksQ9JI70 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MkksQ9JI70 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MkksQ9JI70 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MkksQ9JI70 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MkksQ9JI70 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MkksQ9JI70 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MkksQ9JI70 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MkksQ9JI70 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MkksQ9JI70 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MkksQ9JI70 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MkksQ9JI70 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms