Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB5

Slco1c1, Solute carrier organic anion transporter family member 1C1, mousemouse

Predictions only

Length 715 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slco1c1Q9ERB5 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slco1c1Q9ERB5 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slco1c1Q9ERB5 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slco1c1Q9ERB5 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slco1c1Q9ERB5 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slco1c1Q9ERB5 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slco1c1Q9ERB5 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slco1c1Q9ERB5 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slco1c1Q9ERB5 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slco1c1Q9ERB5 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slco1c1Q9ERB5 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slco1c1Q9ERB5 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slco1c1Q9ERB5 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slco1c1Q9ERB5 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slco1c1Q9ERB5 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slco1c1Q9ERB5 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slco1c1Q9ERB5 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slco1c1Q9ERB5 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slco1c1Q9ERB5 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slco1c1Q9ERB5 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Slco1c1Q9ERB5 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Slco1c1Q9ERB5 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Slco1c1Q9ERB5 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Slco1c1Q9ERB5 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Slco1c1Q9ERB5 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Slco1c1Q9ERB5 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Slco1c1Q9ERB5 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slco1c1Q9ERB5 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slco1c1Q9ERB5 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slco1c1Q9ERB5 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slco1c1Q9ERB5 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slco1c1Q9ERB5 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slco1c1Q9ERB5 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slco1c1Q9ERB5 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slco1c1Q9ERB5 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slco1c1Q9ERB5 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slco1c1Q9ERB5 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slco1c1Q9ERB5 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slco1c1Q9ERB5 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slco1c1Q9ERB5 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slco1c1Q9ERB5 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slco1c1Q9ERB5 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slco1c1Q9ERB5 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slco1c1Q9ERB5 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slco1c1Q9ERB5 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slco1c1Q9ERB5 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slco1c1Q9ERB5 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slco1c1Q9ERB5 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slco1c1Q9ERB5 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slco1c1Q9ERB5 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slco1c1Q9ERB5 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slco1c1Q9ERB5 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slco1c1Q9ERB5 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slco1c1Q9ERB5 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slco1c1Q9ERB5 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slco1c1Q9ERB5 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Slco1c1Q9ERB5 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slco1c1Q9ERB5 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slco1c1Q9ERB5 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slco1c1Q9ERB5 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slco1c1Q9ERB5 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slco1c1Q9ERB5 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Slco1c1Q9ERB5 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slco1c1Q9ERB5 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slco1c1Q9ERB5 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slco1c1Q9ERB5 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slco1c1Q9ERB5 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slco1c1Q9ERB5 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slco1c1Q9ERB5 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slco1c1Q9ERB5 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slco1c1Q9ERB5 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slco1c1Q9ERB5 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slco1c1Q9ERB5 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slco1c1Q9ERB5 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Slco1c1Q9ERB5 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slco1c1Q9ERB5 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slco1c1Q9ERB5 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slco1c1Q9ERB5 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slco1c1Q9ERB5 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slco1c1Q9ERB5 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slco1c1Q9ERB5 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slco1c1Q9ERB5 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Slco1c1Q9ERB5 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slco1c1Q9ERB5 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slco1c1Q9ERB5 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slco1c1Q9ERB5 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slco1c1Q9ERB5 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slco1c1Q9ERB5 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slco1c1Q9ERB5 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slco1c1Q9ERB5 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slco1c1Q9ERB5 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slco1c1Q9ERB5 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slco1c1Q9ERB5 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slco1c1Q9ERB5 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slco1c1Q9ERB5 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slco1c1Q9ERB5 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slco1c1Q9ERB5 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slco1c1Q9ERB5 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Slco1c1Q9ERB5 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slco1c1Q9ERB5 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms