Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ48

V1ra8, Vomeronasal type-1 receptor A8, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V1ra8Q9EQ48 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
V1ra8Q9EQ48 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms