Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCG9

Trmt112, Multifunctional methyltransferase subunit TRM112-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt112Q9DCG9 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trmt112Q9DCG9 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trmt112Q9DCG9 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trmt112Q9DCG9 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trmt112Q9DCG9 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trmt112Q9DCG9 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trmt112Q9DCG9 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trmt112Q9DCG9 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trmt112Q9DCG9 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trmt112Q9DCG9 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trmt112Q9DCG9 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trmt112Q9DCG9 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trmt112Q9DCG9 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trmt112Q9DCG9 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trmt112Q9DCG9 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Trmt112Q9DCG9 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trmt112Q9DCG9 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trmt112Q9DCG9 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trmt112Q9DCG9 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Trmt112Q9DCG9 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trmt112Q9DCG9 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trmt112Q9DCG9 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Trmt112Q9DCG9 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trmt112Q9DCG9 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trmt112Q9DCG9 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trmt112Q9DCG9 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trmt112Q9DCG9 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trmt112Q9DCG9 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trmt112Q9DCG9 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trmt112Q9DCG9 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trmt112Q9DCG9 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trmt112Q9DCG9 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trmt112Q9DCG9 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trmt112Q9DCG9 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trmt112Q9DCG9 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trmt112Q9DCG9 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trmt112Q9DCG9 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trmt112Q9DCG9 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trmt112Q9DCG9 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trmt112Q9DCG9 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trmt112Q9DCG9 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trmt112Q9DCG9 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Trmt112Q9DCG9 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trmt112Q9DCG9 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Trmt112Q9DCG9 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trmt112Q9DCG9 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trmt112Q9DCG9 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trmt112Q9DCG9 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trmt112Q9DCG9 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trmt112Q9DCG9 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trmt112Q9DCG9 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trmt112Q9DCG9 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trmt112Q9DCG9 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trmt112Q9DCG9 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trmt112Q9DCG9 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trmt112Q9DCG9 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trmt112Q9DCG9 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trmt112Q9DCG9 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trmt112Q9DCG9 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trmt112Q9DCG9 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trmt112Q9DCG9 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trmt112Q9DCG9 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trmt112Q9DCG9 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trmt112Q9DCG9 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trmt112Q9DCG9 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trmt112Q9DCG9 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trmt112Q9DCG9 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Trmt112Q9DCG9 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trmt112Q9DCG9 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trmt112Q9DCG9 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trmt112Q9DCG9 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trmt112Q9DCG9 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trmt112Q9DCG9 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trmt112Q9DCG9 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trmt112Q9DCG9 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Trmt112Q9DCG9 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trmt112Q9DCG9 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trmt112Q9DCG9 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trmt112Q9DCG9 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trmt112Q9DCG9 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trmt112Q9DCG9 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trmt112Q9DCG9 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trmt112Q9DCG9 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trmt112Q9DCG9 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trmt112Q9DCG9 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trmt112Q9DCG9 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trmt112Q9DCG9 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trmt112Q9DCG9 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trmt112Q9DCG9 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trmt112Q9DCG9 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trmt112Q9DCG9 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trmt112Q9DCG9 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trmt112Q9DCG9 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trmt112Q9DCG9 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trmt112Q9DCG9 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trmt112Q9DCG9 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trmt112Q9DCG9 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trmt112Q9DCG9 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trmt112Q9DCG9 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trmt112Q9DCG9 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms