Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Syde1Q9DBZ9 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms