Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBC3

Cmtr1, Cap-specific mRNA (nucleoside-2'-O-)-methyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtr1Q9DBC3 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cmtr1Q9DBC3 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms