Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smg9Q9DB90 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smg9Q9DB90 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smg9Q9DB90 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smg9Q9DB90 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smg9Q9DB90 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smg9Q9DB90 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smg9Q9DB90 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smg9Q9DB90 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Smg9Q9DB90 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smg9Q9DB90 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smg9Q9DB90 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smg9Q9DB90 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smg9Q9DB90 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smg9Q9DB90 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smg9Q9DB90 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smg9Q9DB90 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smg9Q9DB90 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smg9Q9DB90 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smg9Q9DB90 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smg9Q9DB90 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smg9Q9DB90 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smg9Q9DB90 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smg9Q9DB90 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smg9Q9DB90 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smg9Q9DB90 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smg9Q9DB90 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smg9Q9DB90 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smg9Q9DB90 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Smg9Q9DB90 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smg9Q9DB90 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smg9Q9DB90 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smg9Q9DB90 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smg9Q9DB90 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smg9Q9DB90 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smg9Q9DB90 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smg9Q9DB90 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smg9Q9DB90 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Smg9Q9DB90 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Smg9Q9DB90 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smg9Q9DB90 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smg9Q9DB90 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smg9Q9DB90 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smg9Q9DB90 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smg9Q9DB90 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smg9Q9DB90 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smg9Q9DB90 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smg9Q9DB90 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smg9Q9DB90 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smg9Q9DB90 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smg9Q9DB90 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smg9Q9DB90 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smg9Q9DB90 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smg9Q9DB90 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smg9Q9DB90 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smg9Q9DB90 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smg9Q9DB90 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smg9Q9DB90 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smg9Q9DB90 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smg9Q9DB90 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smg9Q9DB90 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smg9Q9DB90 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smg9Q9DB90 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smg9Q9DB90 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smg9Q9DB90 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Smg9Q9DB90 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Smg9Q9DB90 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smg9Q9DB90 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Smg9Q9DB90 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smg9Q9DB90 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smg9Q9DB90 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smg9Q9DB90 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smg9Q9DB90 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smg9Q9DB90 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smg9Q9DB90 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smg9Q9DB90 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smg9Q9DB90 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smg9Q9DB90 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smg9Q9DB90 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smg9Q9DB90 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smg9Q9DB90 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Smg9Q9DB90 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smg9Q9DB90 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smg9Q9DB90 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Smg9Q9DB90 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smg9Q9DB90 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smg9Q9DB90 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smg9Q9DB90 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smg9Q9DB90 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smg9Q9DB90 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smg9Q9DB90 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smg9Q9DB90 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smg9Q9DB90 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smg9Q9DB90 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smg9Q9DB90 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smg9Q9DB90 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Smg9Q9DB90 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smg9Q9DB90 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Smg9Q9DB90 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smg9Q9DB90 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms