Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAW6

Prpf4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf4Q9DAW6 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prpf4Q9DAW6 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prpf4Q9DAW6 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prpf4Q9DAW6 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Prpf4Q9DAW6 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prpf4Q9DAW6 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prpf4Q9DAW6 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prpf4Q9DAW6 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prpf4Q9DAW6 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Prpf4Q9DAW6 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Prpf4Q9DAW6 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prpf4Q9DAW6 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prpf4Q9DAW6 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Prpf4Q9DAW6 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prpf4Q9DAW6 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prpf4Q9DAW6 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prpf4Q9DAW6 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prpf4Q9DAW6 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prpf4Q9DAW6 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prpf4Q9DAW6 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prpf4Q9DAW6 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prpf4Q9DAW6 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prpf4Q9DAW6 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prpf4Q9DAW6 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prpf4Q9DAW6 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prpf4Q9DAW6 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Prpf4Q9DAW6 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prpf4Q9DAW6 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prpf4Q9DAW6 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prpf4Q9DAW6 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prpf4Q9DAW6 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prpf4Q9DAW6 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prpf4Q9DAW6 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prpf4Q9DAW6 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms