Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Z7

Subh2bv, Histone H2B subacrosomal variant, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Subh2bvQ9D9Z7 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Subh2bvQ9D9Z7 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Subh2bvQ9D9Z7 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Subh2bvQ9D9Z7 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Subh2bvQ9D9Z7 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Subh2bvQ9D9Z7 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Subh2bvQ9D9Z7 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Subh2bvQ9D9Z7 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Subh2bvQ9D9Z7 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms