Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T7

Slirp, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlirpQ9D8T7 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SlirpQ9D8T7 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SlirpQ9D8T7 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SlirpQ9D8T7 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SlirpQ9D8T7 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SlirpQ9D8T7 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SlirpQ9D8T7 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SlirpQ9D8T7 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SlirpQ9D8T7 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SlirpQ9D8T7 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SlirpQ9D8T7 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SlirpQ9D8T7 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SlirpQ9D8T7 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SlirpQ9D8T7 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SlirpQ9D8T7 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SlirpQ9D8T7 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SlirpQ9D8T7 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SlirpQ9D8T7 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SlirpQ9D8T7 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SlirpQ9D8T7 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SlirpQ9D8T7 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SlirpQ9D8T7 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SlirpQ9D8T7 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SlirpQ9D8T7 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SlirpQ9D8T7 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SlirpQ9D8T7 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SlirpQ9D8T7 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SlirpQ9D8T7 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SlirpQ9D8T7 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SlirpQ9D8T7 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SlirpQ9D8T7 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SlirpQ9D8T7 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SlirpQ9D8T7 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SlirpQ9D8T7 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SlirpQ9D8T7 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SlirpQ9D8T7 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SlirpQ9D8T7 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SlirpQ9D8T7 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SlirpQ9D8T7 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SlirpQ9D8T7 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SlirpQ9D8T7 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SlirpQ9D8T7 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SlirpQ9D8T7 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SlirpQ9D8T7 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SlirpQ9D8T7 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SlirpQ9D8T7 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SlirpQ9D8T7 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SlirpQ9D8T7 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SlirpQ9D8T7 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SlirpQ9D8T7 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SlirpQ9D8T7 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SlirpQ9D8T7 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SlirpQ9D8T7 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SlirpQ9D8T7 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SlirpQ9D8T7 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SlirpQ9D8T7 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SlirpQ9D8T7 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SlirpQ9D8T7 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SlirpQ9D8T7 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SlirpQ9D8T7 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SlirpQ9D8T7 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SlirpQ9D8T7 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SlirpQ9D8T7 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SlirpQ9D8T7 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SlirpQ9D8T7 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SlirpQ9D8T7 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SlirpQ9D8T7 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SlirpQ9D8T7 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SlirpQ9D8T7 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SlirpQ9D8T7 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SlirpQ9D8T7 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SlirpQ9D8T7 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SlirpQ9D8T7 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SlirpQ9D8T7 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SlirpQ9D8T7 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SlirpQ9D8T7 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SlirpQ9D8T7 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SlirpQ9D8T7 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SlirpQ9D8T7 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SlirpQ9D8T7 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SlirpQ9D8T7 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SlirpQ9D8T7 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SlirpQ9D8T7 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SlirpQ9D8T7 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SlirpQ9D8T7 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SlirpQ9D8T7 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SlirpQ9D8T7 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SlirpQ9D8T7 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SlirpQ9D8T7 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SlirpQ9D8T7 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SlirpQ9D8T7 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SlirpQ9D8T7 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SlirpQ9D8T7 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SlirpQ9D8T7 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SlirpQ9D8T7 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SlirpQ9D8T7 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SlirpQ9D8T7 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SlirpQ9D8T7 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SlirpQ9D8T7 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SlirpQ9D8T7 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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