Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf3c6Q9D8P7 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf3c6Q9D8P7 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf3c6Q9D8P7 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf3c6Q9D8P7 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf3c6Q9D8P7 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf3c6Q9D8P7 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf3c6Q9D8P7 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf3c6Q9D8P7 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf3c6Q9D8P7 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf3c6Q9D8P7 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf3c6Q9D8P7 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf3c6Q9D8P7 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf3c6Q9D8P7 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf3c6Q9D8P7 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf3c6Q9D8P7 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf3c6Q9D8P7 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf3c6Q9D8P7 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf3c6Q9D8P7 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf3c6Q9D8P7 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf3c6Q9D8P7 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf3c6Q9D8P7 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf3c6Q9D8P7 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf3c6Q9D8P7 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf3c6Q9D8P7 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf3c6Q9D8P7 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf3c6Q9D8P7 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf3c6Q9D8P7 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf3c6Q9D8P7 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf3c6Q9D8P7 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf3c6Q9D8P7 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf3c6Q9D8P7 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf3c6Q9D8P7 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf3c6Q9D8P7 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf3c6Q9D8P7 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf3c6Q9D8P7 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf3c6Q9D8P7 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf3c6Q9D8P7 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf3c6Q9D8P7 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms