Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8L0

Uncharacterized protein C11orf52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8L0 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q9D8L0 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q9D8L0 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q9D8L0 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q9D8L0 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q9D8L0 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q9D8L0 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q9D8L0 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q9D8L0 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q9D8L0 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q9D8L0 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q9D8L0 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q9D8L0 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q9D8L0 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q9D8L0 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q9D8L0 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q9D8L0 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q9D8L0 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q9D8L0 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q9D8L0 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q9D8L0 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q9D8L0 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q9D8L0 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q9D8L0 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q9D8L0 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q9D8L0 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q9D8L0 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q9D8L0 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q9D8L0 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q9D8L0 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q9D8L0 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q9D8L0 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Q9D8L0 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q9D8L0 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q9D8L0 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q9D8L0 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q9D8L0 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q9D8L0 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Q9D8L0 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q9D8L0 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q9D8L0 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q9D8L0 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q9D8L0 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q9D8L0 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q9D8L0 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q9D8L0 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q9D8L0 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q9D8L0 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9D8L0 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9D8L0 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9D8L0 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9D8L0 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9D8L0 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9D8L0 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9D8L0 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9D8L0 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9D8L0 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9D8L0 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9D8L0 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9D8L0 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9D8L0 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9D8L0 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9D8L0 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9D8L0 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9D8L0 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9D8L0 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9D8L0 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9D8L0 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9D8L0 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9D8L0 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9D8L0 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9D8L0 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9D8L0 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9D8L0 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9D8L0 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9D8L0 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9D8L0 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9D8L0 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9D8L0 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9D8L0 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9D8L0 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9D8L0 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9D8L0 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9D8L0 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9D8L0 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9D8L0 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9D8L0 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9D8L0 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9D8L0 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9D8L0 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9D8L0 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9D8L0 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q9D8L0 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q9D8L0 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q9D8L0 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q9D8L0 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q9D8L0 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q9D8L0 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q9D8L0 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q9D8L0 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.1 ms