Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7Y9

Slx4ip, Protein SLX4IP, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4ipQ9D7Y9 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slx4ipQ9D7Y9 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slx4ipQ9D7Y9 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slx4ipQ9D7Y9 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slx4ipQ9D7Y9 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slx4ipQ9D7Y9 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slx4ipQ9D7Y9 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slx4ipQ9D7Y9 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slx4ipQ9D7Y9 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slx4ipQ9D7Y9 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slx4ipQ9D7Y9 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slx4ipQ9D7Y9 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slx4ipQ9D7Y9 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slx4ipQ9D7Y9 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slx4ipQ9D7Y9 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Slx4ipQ9D7Y9 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slx4ipQ9D7Y9 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slx4ipQ9D7Y9 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slx4ipQ9D7Y9 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slx4ipQ9D7Y9 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slx4ipQ9D7Y9 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slx4ipQ9D7Y9 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slx4ipQ9D7Y9 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slx4ipQ9D7Y9 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slx4ipQ9D7Y9 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slx4ipQ9D7Y9 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slx4ipQ9D7Y9 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slx4ipQ9D7Y9 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slx4ipQ9D7Y9 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slx4ipQ9D7Y9 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slx4ipQ9D7Y9 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slx4ipQ9D7Y9 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Slx4ipQ9D7Y9 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slx4ipQ9D7Y9 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slx4ipQ9D7Y9 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slx4ipQ9D7Y9 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slx4ipQ9D7Y9 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Slx4ipQ9D7Y9 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slx4ipQ9D7Y9 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slx4ipQ9D7Y9 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slx4ipQ9D7Y9 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slx4ipQ9D7Y9 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slx4ipQ9D7Y9 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slx4ipQ9D7Y9 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slx4ipQ9D7Y9 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slx4ipQ9D7Y9 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slx4ipQ9D7Y9 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slx4ipQ9D7Y9 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slx4ipQ9D7Y9 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slx4ipQ9D7Y9 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slx4ipQ9D7Y9 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slx4ipQ9D7Y9 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slx4ipQ9D7Y9 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Slx4ipQ9D7Y9 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slx4ipQ9D7Y9 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slx4ipQ9D7Y9 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Slx4ipQ9D7Y9 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Slx4ipQ9D7Y9 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slx4ipQ9D7Y9 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slx4ipQ9D7Y9 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slx4ipQ9D7Y9 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slx4ipQ9D7Y9 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slx4ipQ9D7Y9 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slx4ipQ9D7Y9 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slx4ipQ9D7Y9 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slx4ipQ9D7Y9 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slx4ipQ9D7Y9 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slx4ipQ9D7Y9 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slx4ipQ9D7Y9 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slx4ipQ9D7Y9 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slx4ipQ9D7Y9 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slx4ipQ9D7Y9 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slx4ipQ9D7Y9 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slx4ipQ9D7Y9 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slx4ipQ9D7Y9 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slx4ipQ9D7Y9 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slx4ipQ9D7Y9 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slx4ipQ9D7Y9 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slx4ipQ9D7Y9 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slx4ipQ9D7Y9 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slx4ipQ9D7Y9 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slx4ipQ9D7Y9 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slx4ipQ9D7Y9 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slx4ipQ9D7Y9 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slx4ipQ9D7Y9 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slx4ipQ9D7Y9 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slx4ipQ9D7Y9 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slx4ipQ9D7Y9 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slx4ipQ9D7Y9 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slx4ipQ9D7Y9 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slx4ipQ9D7Y9 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slx4ipQ9D7Y9 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Slx4ipQ9D7Y9 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Slx4ipQ9D7Y9 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Slx4ipQ9D7Y9 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slx4ipQ9D7Y9 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slx4ipQ9D7Y9 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Slx4ipQ9D7Y9 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slx4ipQ9D7Y9 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slx4ipQ9D7Y9 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms