Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J9

Echdc3, Enoyl-CoA hydratase domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Echdc3Q9D7J9 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Echdc3Q9D7J9 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Echdc3Q9D7J9 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Echdc3Q9D7J9 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Echdc3Q9D7J9 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Echdc3Q9D7J9 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Echdc3Q9D7J9 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Echdc3Q9D7J9 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Echdc3Q9D7J9 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Echdc3Q9D7J9 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Echdc3Q9D7J9 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Echdc3Q9D7J9 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Echdc3Q9D7J9 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Echdc3Q9D7J9 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Echdc3Q9D7J9 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Echdc3Q9D7J9 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Echdc3Q9D7J9 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Echdc3Q9D7J9 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Echdc3Q9D7J9 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Echdc3Q9D7J9 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Echdc3Q9D7J9 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Echdc3Q9D7J9 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Echdc3Q9D7J9 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Echdc3Q9D7J9 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Echdc3Q9D7J9 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Echdc3Q9D7J9 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Echdc3Q9D7J9 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Echdc3Q9D7J9 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Echdc3Q9D7J9 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Echdc3Q9D7J9 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms