Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7H3

RtcA, RNA 3'-terminal phosphate cyclase, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RtcAQ9D7H3 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RtcAQ9D7H3 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RtcAQ9D7H3 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
RtcAQ9D7H3 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RtcAQ9D7H3 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RtcAQ9D7H3 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
RtcAQ9D7H3 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RtcAQ9D7H3 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RtcAQ9D7H3 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RtcAQ9D7H3 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RtcAQ9D7H3 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RtcAQ9D7H3 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RtcAQ9D7H3 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RtcAQ9D7H3 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RtcAQ9D7H3 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RtcAQ9D7H3 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RtcAQ9D7H3 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RtcAQ9D7H3 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RtcAQ9D7H3 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RtcAQ9D7H3 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RtcAQ9D7H3 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RtcAQ9D7H3 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RtcAQ9D7H3 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RtcAQ9D7H3 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RtcAQ9D7H3 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RtcAQ9D7H3 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RtcAQ9D7H3 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RtcAQ9D7H3 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RtcAQ9D7H3 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RtcAQ9D7H3 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RtcAQ9D7H3 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RtcAQ9D7H3 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RtcAQ9D7H3 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RtcAQ9D7H3 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RtcAQ9D7H3 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RtcAQ9D7H3 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RtcAQ9D7H3 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RtcAQ9D7H3 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RtcAQ9D7H3 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RtcAQ9D7H3 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RtcAQ9D7H3 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RtcAQ9D7H3 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RtcAQ9D7H3 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RtcAQ9D7H3 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RtcAQ9D7H3 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RtcAQ9D7H3 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RtcAQ9D7H3 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RtcAQ9D7H3 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RtcAQ9D7H3 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RtcAQ9D7H3 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RtcAQ9D7H3 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RtcAQ9D7H3 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RtcAQ9D7H3 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RtcAQ9D7H3 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RtcAQ9D7H3 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RtcAQ9D7H3 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RtcAQ9D7H3 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RtcAQ9D7H3 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RtcAQ9D7H3 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RtcAQ9D7H3 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RtcAQ9D7H3 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RtcAQ9D7H3 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RtcAQ9D7H3 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RtcAQ9D7H3 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RtcAQ9D7H3 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RtcAQ9D7H3 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RtcAQ9D7H3 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RtcAQ9D7H3 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RtcAQ9D7H3 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RtcAQ9D7H3 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RtcAQ9D7H3 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RtcAQ9D7H3 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RtcAQ9D7H3 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RtcAQ9D7H3 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RtcAQ9D7H3 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RtcAQ9D7H3 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RtcAQ9D7H3 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RtcAQ9D7H3 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RtcAQ9D7H3 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RtcAQ9D7H3 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RtcAQ9D7H3 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RtcAQ9D7H3 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RtcAQ9D7H3 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RtcAQ9D7H3 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RtcAQ9D7H3 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RtcAQ9D7H3 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RtcAQ9D7H3 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RtcAQ9D7H3 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RtcAQ9D7H3 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RtcAQ9D7H3 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RtcAQ9D7H3 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RtcAQ9D7H3 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RtcAQ9D7H3 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RtcAQ9D7H3 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RtcAQ9D7H3 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RtcAQ9D7H3 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RtcAQ9D7H3 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RtcAQ9D7H3 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
RtcAQ9D7H3 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RtcAQ9D7H3 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.2 ms