Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7F7

Chmp4c, Charged multivesicular body protein 4c, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4cQ9D7F7 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chmp4cQ9D7F7 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chmp4cQ9D7F7 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Chmp4cQ9D7F7 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Chmp4cQ9D7F7 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chmp4cQ9D7F7 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chmp4cQ9D7F7 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chmp4cQ9D7F7 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chmp4cQ9D7F7 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chmp4cQ9D7F7 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chmp4cQ9D7F7 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Chmp4cQ9D7F7 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chmp4cQ9D7F7 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chmp4cQ9D7F7 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chmp4cQ9D7F7 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chmp4cQ9D7F7 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chmp4cQ9D7F7 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chmp4cQ9D7F7 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chmp4cQ9D7F7 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chmp4cQ9D7F7 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chmp4cQ9D7F7 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chmp4cQ9D7F7 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chmp4cQ9D7F7 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chmp4cQ9D7F7 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chmp4cQ9D7F7 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chmp4cQ9D7F7 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chmp4cQ9D7F7 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chmp4cQ9D7F7 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chmp4cQ9D7F7 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chmp4cQ9D7F7 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chmp4cQ9D7F7 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chmp4cQ9D7F7 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chmp4cQ9D7F7 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chmp4cQ9D7F7 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chmp4cQ9D7F7 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chmp4cQ9D7F7 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chmp4cQ9D7F7 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chmp4cQ9D7F7 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chmp4cQ9D7F7 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chmp4cQ9D7F7 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chmp4cQ9D7F7 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chmp4cQ9D7F7 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chmp4cQ9D7F7 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chmp4cQ9D7F7 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chmp4cQ9D7F7 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chmp4cQ9D7F7 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chmp4cQ9D7F7 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chmp4cQ9D7F7 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chmp4cQ9D7F7 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chmp4cQ9D7F7 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chmp4cQ9D7F7 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chmp4cQ9D7F7 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chmp4cQ9D7F7 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chmp4cQ9D7F7 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chmp4cQ9D7F7 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chmp4cQ9D7F7 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chmp4cQ9D7F7 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chmp4cQ9D7F7 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chmp4cQ9D7F7 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Chmp4cQ9D7F7 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Chmp4cQ9D7F7 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Chmp4cQ9D7F7 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chmp4cQ9D7F7 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chmp4cQ9D7F7 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chmp4cQ9D7F7 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chmp4cQ9D7F7 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chmp4cQ9D7F7 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chmp4cQ9D7F7 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chmp4cQ9D7F7 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chmp4cQ9D7F7 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chmp4cQ9D7F7 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chmp4cQ9D7F7 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chmp4cQ9D7F7 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chmp4cQ9D7F7 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chmp4cQ9D7F7 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Chmp4cQ9D7F7 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chmp4cQ9D7F7 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chmp4cQ9D7F7 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chmp4cQ9D7F7 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chmp4cQ9D7F7 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chmp4cQ9D7F7 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Chmp4cQ9D7F7 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chmp4cQ9D7F7 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chmp4cQ9D7F7 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chmp4cQ9D7F7 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chmp4cQ9D7F7 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chmp4cQ9D7F7 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chmp4cQ9D7F7 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chmp4cQ9D7F7 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chmp4cQ9D7F7 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chmp4cQ9D7F7 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chmp4cQ9D7F7 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chmp4cQ9D7F7 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chmp4cQ9D7F7 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chmp4cQ9D7F7 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chmp4cQ9D7F7 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chmp4cQ9D7F7 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chmp4cQ9D7F7 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chmp4cQ9D7F7 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chmp4cQ9D7F7 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms