Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y7

Msra, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, mousemouse

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsraQ9D6Y7 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MsraQ9D6Y7 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MsraQ9D6Y7 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MsraQ9D6Y7 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MsraQ9D6Y7 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MsraQ9D6Y7 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MsraQ9D6Y7 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MsraQ9D6Y7 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
MsraQ9D6Y7 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MsraQ9D6Y7 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MsraQ9D6Y7 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
MsraQ9D6Y7 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MsraQ9D6Y7 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MsraQ9D6Y7 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MsraQ9D6Y7 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MsraQ9D6Y7 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MsraQ9D6Y7 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MsraQ9D6Y7 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MsraQ9D6Y7 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MsraQ9D6Y7 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MsraQ9D6Y7 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
MsraQ9D6Y7 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
MsraQ9D6Y7 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MsraQ9D6Y7 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MsraQ9D6Y7 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MsraQ9D6Y7 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MsraQ9D6Y7 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MsraQ9D6Y7 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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MsraQ9D6Y7 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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MsraQ9D6Y7 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
MsraQ9D6Y7 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MsraQ9D6Y7 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MsraQ9D6Y7 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MsraQ9D6Y7 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MsraQ9D6Y7 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MsraQ9D6Y7 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MsraQ9D6Y7 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MsraQ9D6Y7 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MsraQ9D6Y7 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MsraQ9D6Y7 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MsraQ9D6Y7 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MsraQ9D6Y7 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MsraQ9D6Y7 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MsraQ9D6Y7 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MsraQ9D6Y7 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MsraQ9D6Y7 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MsraQ9D6Y7 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MsraQ9D6Y7 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MsraQ9D6Y7 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MsraQ9D6Y7 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MsraQ9D6Y7 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
MsraQ9D6Y7 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
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MsraQ9D6Y7 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MsraQ9D6Y7 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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MsraQ9D6Y7 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MsraQ9D6Y7 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MsraQ9D6Y7 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MsraQ9D6Y7 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
MsraQ9D6Y7 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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MsraQ9D6Y7 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MsraQ9D6Y7 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MsraQ9D6Y7 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MsraQ9D6Y7 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MsraQ9D6Y7 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MsraQ9D6Y7 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MsraQ9D6Y7 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MsraQ9D6Y7 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MsraQ9D6Y7 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
MsraQ9D6Y7 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MsraQ9D6Y7 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MsraQ9D6Y7 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MsraQ9D6Y7 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MsraQ9D6Y7 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MsraQ9D6Y7 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MsraQ9D6Y7 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MsraQ9D6Y7 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MsraQ9D6Y7 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MsraQ9D6Y7 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MsraQ9D6Y7 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MsraQ9D6Y7 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MsraQ9D6Y7 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MsraQ9D6Y7 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MsraQ9D6Y7 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MsraQ9D6Y7 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MsraQ9D6Y7 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MsraQ9D6Y7 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MsraQ9D6Y7 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MsraQ9D6Y7 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
MsraQ9D6Y7 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms