Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6F9

Tubb4a, Tubulin beta-4A chain, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4aQ9D6F9 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tubb4aQ9D6F9 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tubb4aQ9D6F9 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tubb4aQ9D6F9 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tubb4aQ9D6F9 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tubb4aQ9D6F9 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tubb4aQ9D6F9 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tubb4aQ9D6F9 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tubb4aQ9D6F9 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tubb4aQ9D6F9 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tubb4aQ9D6F9 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tubb4aQ9D6F9 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tubb4aQ9D6F9 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tubb4aQ9D6F9 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tubb4aQ9D6F9 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tubb4aQ9D6F9 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tubb4aQ9D6F9 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tubb4aQ9D6F9 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tubb4aQ9D6F9 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tubb4aQ9D6F9 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tubb4aQ9D6F9 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tubb4aQ9D6F9 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tubb4aQ9D6F9 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms