Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Y1

Ccdc39, Coiled-coil domain-containing protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc39Q9D5Y1 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc39Q9D5Y1 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc39Q9D5Y1 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc39Q9D5Y1 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc39Q9D5Y1 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc39Q9D5Y1 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc39Q9D5Y1 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc39Q9D5Y1 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc39Q9D5Y1 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc39Q9D5Y1 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc39Q9D5Y1 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc39Q9D5Y1 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc39Q9D5Y1 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc39Q9D5Y1 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc39Q9D5Y1 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc39Q9D5Y1 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc39Q9D5Y1 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc39Q9D5Y1 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc39Q9D5Y1 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc39Q9D5Y1 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc39Q9D5Y1 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc39Q9D5Y1 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc39Q9D5Y1 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc39Q9D5Y1 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc39Q9D5Y1 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc39Q9D5Y1 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc39Q9D5Y1 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc39Q9D5Y1 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc39Q9D5Y1 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc39Q9D5Y1 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc39Q9D5Y1 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc39Q9D5Y1 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc39Q9D5Y1 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc39Q9D5Y1 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc39Q9D5Y1 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc39Q9D5Y1 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc39Q9D5Y1 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc39Q9D5Y1 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc39Q9D5Y1 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc39Q9D5Y1 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc39Q9D5Y1 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc39Q9D5Y1 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc39Q9D5Y1 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc39Q9D5Y1 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc39Q9D5Y1 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc39Q9D5Y1 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc39Q9D5Y1 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc39Q9D5Y1 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc39Q9D5Y1 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc39Q9D5Y1 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc39Q9D5Y1 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc39Q9D5Y1 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc39Q9D5Y1 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc39Q9D5Y1 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc39Q9D5Y1 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc39Q9D5Y1 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc39Q9D5Y1 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc39Q9D5Y1 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc39Q9D5Y1 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc39Q9D5Y1 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc39Q9D5Y1 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc39Q9D5Y1 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc39Q9D5Y1 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc39Q9D5Y1 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc39Q9D5Y1 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc39Q9D5Y1 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc39Q9D5Y1 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc39Q9D5Y1 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc39Q9D5Y1 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc39Q9D5Y1 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc39Q9D5Y1 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc39Q9D5Y1 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ccdc39Q9D5Y1 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ccdc39Q9D5Y1 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ccdc39Q9D5Y1 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ccdc39Q9D5Y1 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc39Q9D5Y1 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc39Q9D5Y1 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc39Q9D5Y1 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc39Q9D5Y1 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc39Q9D5Y1 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc39Q9D5Y1 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc39Q9D5Y1 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc39Q9D5Y1 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc39Q9D5Y1 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc39Q9D5Y1 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc39Q9D5Y1 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc39Q9D5Y1 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc39Q9D5Y1 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc39Q9D5Y1 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc39Q9D5Y1 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc39Q9D5Y1 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc39Q9D5Y1 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc39Q9D5Y1 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc39Q9D5Y1 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc39Q9D5Y1 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc39Q9D5Y1 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc39Q9D5Y1 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc39Q9D5Y1 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc39Q9D5Y1 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms