Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5V6

Syap1, Synapse-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syap1Q9D5V6 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syap1Q9D5V6 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syap1Q9D5V6 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syap1Q9D5V6 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syap1Q9D5V6 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syap1Q9D5V6 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Syap1Q9D5V6 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syap1Q9D5V6 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syap1Q9D5V6 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syap1Q9D5V6 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syap1Q9D5V6 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syap1Q9D5V6 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syap1Q9D5V6 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syap1Q9D5V6 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syap1Q9D5V6 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syap1Q9D5V6 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syap1Q9D5V6 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syap1Q9D5V6 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Syap1Q9D5V6 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syap1Q9D5V6 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syap1Q9D5V6 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syap1Q9D5V6 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syap1Q9D5V6 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syap1Q9D5V6 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syap1Q9D5V6 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syap1Q9D5V6 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syap1Q9D5V6 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syap1Q9D5V6 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syap1Q9D5V6 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syap1Q9D5V6 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syap1Q9D5V6 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syap1Q9D5V6 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syap1Q9D5V6 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syap1Q9D5V6 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syap1Q9D5V6 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syap1Q9D5V6 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syap1Q9D5V6 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syap1Q9D5V6 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syap1Q9D5V6 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Syap1Q9D5V6 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syap1Q9D5V6 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syap1Q9D5V6 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syap1Q9D5V6 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syap1Q9D5V6 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syap1Q9D5V6 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syap1Q9D5V6 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syap1Q9D5V6 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Syap1Q9D5V6 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syap1Q9D5V6 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syap1Q9D5V6 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Syap1Q9D5V6 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syap1Q9D5V6 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syap1Q9D5V6 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syap1Q9D5V6 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syap1Q9D5V6 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syap1Q9D5V6 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syap1Q9D5V6 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syap1Q9D5V6 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syap1Q9D5V6 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syap1Q9D5V6 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syap1Q9D5V6 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syap1Q9D5V6 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syap1Q9D5V6 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syap1Q9D5V6 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syap1Q9D5V6 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Syap1Q9D5V6 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Syap1Q9D5V6 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Syap1Q9D5V6 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Syap1Q9D5V6 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Syap1Q9D5V6 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syap1Q9D5V6 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syap1Q9D5V6 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syap1Q9D5V6 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syap1Q9D5V6 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Syap1Q9D5V6 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syap1Q9D5V6 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syap1Q9D5V6 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Syap1Q9D5V6 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syap1Q9D5V6 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syap1Q9D5V6 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syap1Q9D5V6 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syap1Q9D5V6 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syap1Q9D5V6 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syap1Q9D5V6 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syap1Q9D5V6 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syap1Q9D5V6 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syap1Q9D5V6 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syap1Q9D5V6 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syap1Q9D5V6 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syap1Q9D5V6 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syap1Q9D5V6 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syap1Q9D5V6 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syap1Q9D5V6 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syap1Q9D5V6 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syap1Q9D5V6 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syap1Q9D5V6 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syap1Q9D5V6 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syap1Q9D5V6 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syap1Q9D5V6 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syap1Q9D5V6 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms