Protein–RNA interactions for Protein: Q9D572

Ubxn11, UBX domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn11Q9D572 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubxn11Q9D572 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubxn11Q9D572 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubxn11Q9D572 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubxn11Q9D572 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubxn11Q9D572 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubxn11Q9D572 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubxn11Q9D572 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubxn11Q9D572 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubxn11Q9D572 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubxn11Q9D572 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubxn11Q9D572 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubxn11Q9D572 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubxn11Q9D572 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubxn11Q9D572 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubxn11Q9D572 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubxn11Q9D572 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubxn11Q9D572 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubxn11Q9D572 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubxn11Q9D572 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubxn11Q9D572 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubxn11Q9D572 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubxn11Q9D572 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubxn11Q9D572 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ubxn11Q9D572 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ubxn11Q9D572 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ubxn11Q9D572 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ubxn11Q9D572 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ubxn11Q9D572 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ubxn11Q9D572 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ubxn11Q9D572 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ubxn11Q9D572 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ubxn11Q9D572 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ubxn11Q9D572 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ubxn11Q9D572 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ubxn11Q9D572 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ubxn11Q9D572 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ubxn11Q9D572 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ubxn11Q9D572 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ubxn11Q9D572 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ubxn11Q9D572 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ubxn11Q9D572 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ubxn11Q9D572 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ubxn11Q9D572 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ubxn11Q9D572 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ubxn11Q9D572 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ubxn11Q9D572 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ubxn11Q9D572 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ubxn11Q9D572 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ubxn11Q9D572 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ubxn11Q9D572 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ubxn11Q9D572 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ubxn11Q9D572 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms