Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4S4

4930564D02Rik, RIKEN cDNA 4930564D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930564D02RikQ9D4S4 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930564D02RikQ9D4S4 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
4930564D02RikQ9D4S4 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930564D02RikQ9D4S4 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930564D02RikQ9D4S4 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930564D02RikQ9D4S4 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930564D02RikQ9D4S4 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930564D02RikQ9D4S4 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930564D02RikQ9D4S4 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930564D02RikQ9D4S4 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930564D02RikQ9D4S4 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930564D02RikQ9D4S4 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930564D02RikQ9D4S4 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930564D02RikQ9D4S4 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930564D02RikQ9D4S4 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930564D02RikQ9D4S4 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930564D02RikQ9D4S4 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930564D02RikQ9D4S4 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930564D02RikQ9D4S4 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930564D02RikQ9D4S4 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930564D02RikQ9D4S4 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930564D02RikQ9D4S4 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930564D02RikQ9D4S4 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930564D02RikQ9D4S4 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930564D02RikQ9D4S4 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930564D02RikQ9D4S4 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930564D02RikQ9D4S4 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930564D02RikQ9D4S4 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930564D02RikQ9D4S4 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930564D02RikQ9D4S4 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930564D02RikQ9D4S4 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930564D02RikQ9D4S4 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930564D02RikQ9D4S4 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930564D02RikQ9D4S4 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930564D02RikQ9D4S4 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930564D02RikQ9D4S4 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930564D02RikQ9D4S4 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930564D02RikQ9D4S4 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
4930564D02RikQ9D4S4 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930564D02RikQ9D4S4 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930564D02RikQ9D4S4 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930564D02RikQ9D4S4 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930564D02RikQ9D4S4 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930564D02RikQ9D4S4 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930564D02RikQ9D4S4 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930564D02RikQ9D4S4 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930564D02RikQ9D4S4 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
4930564D02RikQ9D4S4 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930564D02RikQ9D4S4 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930564D02RikQ9D4S4 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930564D02RikQ9D4S4 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930564D02RikQ9D4S4 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930564D02RikQ9D4S4 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930564D02RikQ9D4S4 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930564D02RikQ9D4S4 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930564D02RikQ9D4S4 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930564D02RikQ9D4S4 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930564D02RikQ9D4S4 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930564D02RikQ9D4S4 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930564D02RikQ9D4S4 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930564D02RikQ9D4S4 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930564D02RikQ9D4S4 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930564D02RikQ9D4S4 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930564D02RikQ9D4S4 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930564D02RikQ9D4S4 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930564D02RikQ9D4S4 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930564D02RikQ9D4S4 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930564D02RikQ9D4S4 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930564D02RikQ9D4S4 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930564D02RikQ9D4S4 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
4930564D02RikQ9D4S4 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930564D02RikQ9D4S4 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930564D02RikQ9D4S4 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930564D02RikQ9D4S4 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930564D02RikQ9D4S4 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930564D02RikQ9D4S4 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930564D02RikQ9D4S4 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930564D02RikQ9D4S4 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930564D02RikQ9D4S4 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930564D02RikQ9D4S4 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
4930564D02RikQ9D4S4 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930564D02RikQ9D4S4 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
4930564D02RikQ9D4S4 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930564D02RikQ9D4S4 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930564D02RikQ9D4S4 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930564D02RikQ9D4S4 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930564D02RikQ9D4S4 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930564D02RikQ9D4S4 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930564D02RikQ9D4S4 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930564D02RikQ9D4S4 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930564D02RikQ9D4S4 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930564D02RikQ9D4S4 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930564D02RikQ9D4S4 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930564D02RikQ9D4S4 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930564D02RikQ9D4S4 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930564D02RikQ9D4S4 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930564D02RikQ9D4S4 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930564D02RikQ9D4S4 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930564D02RikQ9D4S4 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930564D02RikQ9D4S4 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms