Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lonrf3Q9D4H7 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms