Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Syce1Q9D495 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms