Protein–RNA interactions for Protein: Q9D454

Uncharacterized protein CXorf49 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D454 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9D454 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9D454 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9D454 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9D454 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D454 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D454 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D454 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D454 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D454 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D454 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D454 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D454 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D454 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D454 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D454 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D454 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D454 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D454 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D454 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D454 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D454 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D454 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D454 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D454 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D454 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D454 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D454 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D454 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D454 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D454 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D454 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D454 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D454 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D454 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D454 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D454 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D454 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D454 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D454 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D454 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D454 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D454 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D454 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D454 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D454 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D454 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D454 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D454 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D454 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D454 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D454 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D454 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D454 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D454 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D454 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D454 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D454 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D454 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D454 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D454 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D454 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D454 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D454 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D454 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D454 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D454 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D454 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D454 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D454 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D454 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D454 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D454 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D454 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D454 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D454 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D454 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D454 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D454 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D454 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D454 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D454 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D454 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D454 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D454 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D454 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D454 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D454 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D454 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D454 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D454 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D454 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D454 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D454 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D454 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D454 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D454 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D454 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D454 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D454 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms