Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2J4

Vsig1, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsig1Q9D2J4 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vsig1Q9D2J4 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vsig1Q9D2J4 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vsig1Q9D2J4 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vsig1Q9D2J4 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vsig1Q9D2J4 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vsig1Q9D2J4 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vsig1Q9D2J4 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vsig1Q9D2J4 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Vsig1Q9D2J4 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vsig1Q9D2J4 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Vsig1Q9D2J4 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Vsig1Q9D2J4 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Vsig1Q9D2J4 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Vsig1Q9D2J4 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vsig1Q9D2J4 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vsig1Q9D2J4 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vsig1Q9D2J4 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vsig1Q9D2J4 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vsig1Q9D2J4 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vsig1Q9D2J4 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vsig1Q9D2J4 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vsig1Q9D2J4 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vsig1Q9D2J4 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vsig1Q9D2J4 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vsig1Q9D2J4 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vsig1Q9D2J4 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vsig1Q9D2J4 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vsig1Q9D2J4 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vsig1Q9D2J4 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vsig1Q9D2J4 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vsig1Q9D2J4 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Vsig1Q9D2J4 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vsig1Q9D2J4 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vsig1Q9D2J4 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vsig1Q9D2J4 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.07■□□□□ 0
Vsig1Q9D2J4 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vsig1Q9D2J4 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vsig1Q9D2J4 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Vsig1Q9D2J4 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Vsig1Q9D2J4 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Vsig1Q9D2J4 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vsig1Q9D2J4 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vsig1Q9D2J4 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Vsig1Q9D2J4 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vsig1Q9D2J4 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vsig1Q9D2J4 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vsig1Q9D2J4 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vsig1Q9D2J4 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vsig1Q9D2J4 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vsig1Q9D2J4 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vsig1Q9D2J4 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vsig1Q9D2J4 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vsig1Q9D2J4 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Vsig1Q9D2J4 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vsig1Q9D2J4 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vsig1Q9D2J4 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vsig1Q9D2J4 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vsig1Q9D2J4 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vsig1Q9D2J4 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vsig1Q9D2J4 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vsig1Q9D2J4 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vsig1Q9D2J4 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vsig1Q9D2J4 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vsig1Q9D2J4 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vsig1Q9D2J4 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vsig1Q9D2J4 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vsig1Q9D2J4 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vsig1Q9D2J4 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vsig1Q9D2J4 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vsig1Q9D2J4 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vsig1Q9D2J4 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vsig1Q9D2J4 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vsig1Q9D2J4 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vsig1Q9D2J4 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Vsig1Q9D2J4 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Vsig1Q9D2J4 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Vsig1Q9D2J4 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vsig1Q9D2J4 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vsig1Q9D2J4 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vsig1Q9D2J4 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vsig1Q9D2J4 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Vsig1Q9D2J4 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vsig1Q9D2J4 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vsig1Q9D2J4 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vsig1Q9D2J4 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vsig1Q9D2J4 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vsig1Q9D2J4 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vsig1Q9D2J4 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vsig1Q9D2J4 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vsig1Q9D2J4 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vsig1Q9D2J4 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vsig1Q9D2J4 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vsig1Q9D2J4 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vsig1Q9D2J4 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vsig1Q9D2J4 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vsig1Q9D2J4 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Vsig1Q9D2J4 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Vsig1Q9D2J4 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vsig1Q9D2J4 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms