Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Trappc6bQ9D289 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Trappc6bQ9D289 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Trappc6bQ9D289 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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