Protein–RNA interactions for Protein: Q9D232

Spns3, Protein spinster homolog 3, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spns3Q9D232 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Spns3Q9D232 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Spns3Q9D232 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Spns3Q9D232 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Spns3Q9D232 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Spns3Q9D232 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Spns3Q9D232 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Spns3Q9D232 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Spns3Q9D232 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Spns3Q9D232 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Spns3Q9D232 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Spns3Q9D232 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Spns3Q9D232 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Spns3Q9D232 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Spns3Q9D232 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Spns3Q9D232 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Spns3Q9D232 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Spns3Q9D232 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Spns3Q9D232 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Spns3Q9D232 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Spns3Q9D232 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Spns3Q9D232 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Spns3Q9D232 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Spns3Q9D232 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Spns3Q9D232 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Spns3Q9D232 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Spns3Q9D232 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Spns3Q9D232 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Spns3Q9D232 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Spns3Q9D232 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Spns3Q9D232 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Spns3Q9D232 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Spns3Q9D232 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Spns3Q9D232 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Spns3Q9D232 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Spns3Q9D232 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Spns3Q9D232 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Spns3Q9D232 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Spns3Q9D232 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Spns3Q9D232 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Spns3Q9D232 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Spns3Q9D232 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Spns3Q9D232 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Spns3Q9D232 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Spns3Q9D232 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Spns3Q9D232 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Spns3Q9D232 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Spns3Q9D232 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Spns3Q9D232 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Spns3Q9D232 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Spns3Q9D232 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Spns3Q9D232 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Spns3Q9D232 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Spns3Q9D232 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Spns3Q9D232 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Spns3Q9D232 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Spns3Q9D232 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Spns3Q9D232 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Spns3Q9D232 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Spns3Q9D232 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Spns3Q9D232 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Spns3Q9D232 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Spns3Q9D232 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Spns3Q9D232 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Spns3Q9D232 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Spns3Q9D232 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Spns3Q9D232 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Spns3Q9D232 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Spns3Q9D232 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Spns3Q9D232 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Spns3Q9D232 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Spns3Q9D232 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Spns3Q9D232 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Spns3Q9D232 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Spns3Q9D232 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Spns3Q9D232 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Spns3Q9D232 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Spns3Q9D232 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Spns3Q9D232 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Spns3Q9D232 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Spns3Q9D232 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Spns3Q9D232 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Spns3Q9D232 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Spns3Q9D232 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Spns3Q9D232 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.08□□□□□ -0.15
Spns3Q9D232 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Spns3Q9D232 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.08□□□□□ -0.15
Spns3Q9D232 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Spns3Q9D232 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Spns3Q9D232 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Spns3Q9D232 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Spns3Q9D232 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Spns3Q9D232 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Spns3Q9D232 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Spns3Q9D232 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Spns3Q9D232 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Spns3Q9D232 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Spns3Q9D232 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Spns3Q9D232 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Spns3Q9D232 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms