Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1P4

Chordc1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chordc1Q9D1P4 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chordc1Q9D1P4 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms