Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1J3

Sarnp, SAP domain-containing ribonucleoprotein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SarnpQ9D1J3 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
SarnpQ9D1J3 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SarnpQ9D1J3 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms