Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1H8

Mrpl53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl53Q9D1H8 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mrpl53Q9D1H8 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mrpl53Q9D1H8 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mrpl53Q9D1H8 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mrpl53Q9D1H8 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mrpl53Q9D1H8 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mrpl53Q9D1H8 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mrpl53Q9D1H8 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mrpl53Q9D1H8 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mrpl53Q9D1H8 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Mrpl53Q9D1H8 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mrpl53Q9D1H8 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mrpl53Q9D1H8 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mrpl53Q9D1H8 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mrpl53Q9D1H8 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mrpl53Q9D1H8 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mrpl53Q9D1H8 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mrpl53Q9D1H8 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mrpl53Q9D1H8 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mrpl53Q9D1H8 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mrpl53Q9D1H8 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mrpl53Q9D1H8 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mrpl53Q9D1H8 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mrpl53Q9D1H8 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mrpl53Q9D1H8 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mrpl53Q9D1H8 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mrpl53Q9D1H8 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mrpl53Q9D1H8 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Mrpl53Q9D1H8 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mrpl53Q9D1H8 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mrpl53Q9D1H8 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mrpl53Q9D1H8 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mrpl53Q9D1H8 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mrpl53Q9D1H8 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mrpl53Q9D1H8 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mrpl53Q9D1H8 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mrpl53Q9D1H8 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mrpl53Q9D1H8 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mrpl53Q9D1H8 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mrpl53Q9D1H8 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mrpl53Q9D1H8 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mrpl53Q9D1H8 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mrpl53Q9D1H8 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl53Q9D1H8 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl53Q9D1H8 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl53Q9D1H8 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl53Q9D1H8 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl53Q9D1H8 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl53Q9D1H8 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl53Q9D1H8 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl53Q9D1H8 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl53Q9D1H8 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl53Q9D1H8 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl53Q9D1H8 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl53Q9D1H8 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl53Q9D1H8 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl53Q9D1H8 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl53Q9D1H8 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl53Q9D1H8 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl53Q9D1H8 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl53Q9D1H8 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl53Q9D1H8 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl53Q9D1H8 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl53Q9D1H8 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl53Q9D1H8 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl53Q9D1H8 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl53Q9D1H8 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl53Q9D1H8 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl53Q9D1H8 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl53Q9D1H8 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl53Q9D1H8 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl53Q9D1H8 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl53Q9D1H8 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl53Q9D1H8 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl53Q9D1H8 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl53Q9D1H8 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl53Q9D1H8 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl53Q9D1H8 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl53Q9D1H8 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mrpl53Q9D1H8 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Mrpl53Q9D1H8 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Mrpl53Q9D1H8 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Mrpl53Q9D1H8 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Mrpl53Q9D1H8 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Mrpl53Q9D1H8 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Mrpl53Q9D1H8 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Mrpl53Q9D1H8 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Mrpl53Q9D1H8 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Mrpl53Q9D1H8 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Mrpl53Q9D1H8 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl53Q9D1H8 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl53Q9D1H8 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl53Q9D1H8 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl53Q9D1H8 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl53Q9D1H8 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl53Q9D1H8 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl53Q9D1H8 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl53Q9D1H8 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl53Q9D1H8 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mrpl53Q9D1H8 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95 ms