Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E5

Lmbr1l, Protein LMBR1L, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1lQ9D1E5 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lmbr1lQ9D1E5 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lmbr1lQ9D1E5 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Lmbr1lQ9D1E5 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lmbr1lQ9D1E5 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lmbr1lQ9D1E5 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lmbr1lQ9D1E5 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lmbr1lQ9D1E5 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lmbr1lQ9D1E5 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lmbr1lQ9D1E5 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lmbr1lQ9D1E5 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lmbr1lQ9D1E5 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lmbr1lQ9D1E5 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lmbr1lQ9D1E5 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lmbr1lQ9D1E5 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lmbr1lQ9D1E5 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lmbr1lQ9D1E5 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lmbr1lQ9D1E5 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lmbr1lQ9D1E5 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lmbr1lQ9D1E5 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lmbr1lQ9D1E5 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lmbr1lQ9D1E5 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lmbr1lQ9D1E5 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lmbr1lQ9D1E5 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lmbr1lQ9D1E5 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lmbr1lQ9D1E5 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Lmbr1lQ9D1E5 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lmbr1lQ9D1E5 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lmbr1lQ9D1E5 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Lmbr1lQ9D1E5 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Lmbr1lQ9D1E5 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lmbr1lQ9D1E5 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lmbr1lQ9D1E5 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Lmbr1lQ9D1E5 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lmbr1lQ9D1E5 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lmbr1lQ9D1E5 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lmbr1lQ9D1E5 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lmbr1lQ9D1E5 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lmbr1lQ9D1E5 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lmbr1lQ9D1E5 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lmbr1lQ9D1E5 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lmbr1lQ9D1E5 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lmbr1lQ9D1E5 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lmbr1lQ9D1E5 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmbr1lQ9D1E5 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmbr1lQ9D1E5 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmbr1lQ9D1E5 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmbr1lQ9D1E5 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmbr1lQ9D1E5 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmbr1lQ9D1E5 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmbr1lQ9D1E5 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmbr1lQ9D1E5 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmbr1lQ9D1E5 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmbr1lQ9D1E5 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmbr1lQ9D1E5 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmbr1lQ9D1E5 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmbr1lQ9D1E5 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmbr1lQ9D1E5 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmbr1lQ9D1E5 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmbr1lQ9D1E5 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmbr1lQ9D1E5 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmbr1lQ9D1E5 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmbr1lQ9D1E5 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmbr1lQ9D1E5 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmbr1lQ9D1E5 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmbr1lQ9D1E5 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmbr1lQ9D1E5 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmbr1lQ9D1E5 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmbr1lQ9D1E5 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmbr1lQ9D1E5 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmbr1lQ9D1E5 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmbr1lQ9D1E5 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmbr1lQ9D1E5 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmbr1lQ9D1E5 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmbr1lQ9D1E5 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lmbr1lQ9D1E5 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lmbr1lQ9D1E5 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lmbr1lQ9D1E5 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lmbr1lQ9D1E5 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lmbr1lQ9D1E5 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lmbr1lQ9D1E5 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lmbr1lQ9D1E5 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lmbr1lQ9D1E5 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lmbr1lQ9D1E5 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lmbr1lQ9D1E5 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lmbr1lQ9D1E5 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lmbr1lQ9D1E5 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lmbr1lQ9D1E5 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lmbr1lQ9D1E5 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lmbr1lQ9D1E5 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lmbr1lQ9D1E5 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lmbr1lQ9D1E5 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lmbr1lQ9D1E5 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lmbr1lQ9D1E5 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lmbr1lQ9D1E5 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lmbr1lQ9D1E5 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lmbr1lQ9D1E5 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lmbr1lQ9D1E5 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lmbr1lQ9D1E5 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lmbr1lQ9D1E5 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms