Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW4

Rpl11, 60S ribosomal protein L11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl11Q9CXW4 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpl11Q9CXW4 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms