Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX9

Ddx47, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ddx47Q9CWX9 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddx47Q9CWX9 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddx47Q9CWX9 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx47Q9CWX9 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx47Q9CWX9 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx47Q9CWX9 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx47Q9CWX9 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx47Q9CWX9 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx47Q9CWX9 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx47Q9CWX9 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Ddx47Q9CWX9 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx47Q9CWX9 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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