Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Rpusd4Q9CWX4 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rpusd4Q9CWX4 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rpusd4Q9CWX4 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rpusd4Q9CWX4 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Rpusd4Q9CWX4 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rpusd4Q9CWX4 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rpusd4Q9CWX4 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rpusd4Q9CWX4 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
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