Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU5

Khdc3, KH domain-containing protein 3, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc3Q9CWU5 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Khdc3Q9CWU5 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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