Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUU3

Sycp2, Synaptonemal complex protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp2Q9CUU3 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Sycp2Q9CUU3 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Sycp2Q9CUU3 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Sycp2Q9CUU3 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Sycp2Q9CUU3 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Sycp2Q9CUU3 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Sycp2Q9CUU3 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Sycp2Q9CUU3 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Sycp2Q9CUU3 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Sycp2Q9CUU3 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Sycp2Q9CUU3 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Sycp2Q9CUU3 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Sycp2Q9CUU3 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Sycp2Q9CUU3 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Sycp2Q9CUU3 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Sycp2Q9CUU3 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Sycp2Q9CUU3 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Sycp2Q9CUU3 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Sycp2Q9CUU3 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Sycp2Q9CUU3 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Sycp2Q9CUU3 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Sycp2Q9CUU3 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Sycp2Q9CUU3 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Sycp2Q9CUU3 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Sycp2Q9CUU3 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Sycp2Q9CUU3 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Sycp2Q9CUU3 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Sycp2Q9CUU3 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Sycp2Q9CUU3 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Sycp2Q9CUU3 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Sycp2Q9CUU3 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Sycp2Q9CUU3 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Sycp2Q9CUU3 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Sycp2Q9CUU3 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Sycp2Q9CUU3 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Sycp2Q9CUU3 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Sycp2Q9CUU3 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Sycp2Q9CUU3 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Sycp2Q9CUU3 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Sycp2Q9CUU3 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Sycp2Q9CUU3 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Sycp2Q9CUU3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Sycp2Q9CUU3 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Sycp2Q9CUU3 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Sycp2Q9CUU3 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Sycp2Q9CUU3 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Sycp2Q9CUU3 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Sycp2Q9CUU3 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Sycp2Q9CUU3 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Sycp2Q9CUU3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sycp2Q9CUU3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sycp2Q9CUU3 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sycp2Q9CUU3 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sycp2Q9CUU3 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sycp2Q9CUU3 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sycp2Q9CUU3 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sycp2Q9CUU3 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sycp2Q9CUU3 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sycp2Q9CUU3 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sycp2Q9CUU3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sycp2Q9CUU3 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sycp2Q9CUU3 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sycp2Q9CUU3 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sycp2Q9CUU3 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Sycp2Q9CUU3 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sycp2Q9CUU3 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sycp2Q9CUU3 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sycp2Q9CUU3 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sycp2Q9CUU3 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sycp2Q9CUU3 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sycp2Q9CUU3 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sycp2Q9CUU3 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sycp2Q9CUU3 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sycp2Q9CUU3 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sycp2Q9CUU3 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sycp2Q9CUU3 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sycp2Q9CUU3 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sycp2Q9CUU3 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sycp2Q9CUU3 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Sycp2Q9CUU3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sycp2Q9CUU3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sycp2Q9CUU3 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Sycp2Q9CUU3 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Sycp2Q9CUU3 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Sycp2Q9CUU3 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Sycp2Q9CUU3 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Sycp2Q9CUU3 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Sycp2Q9CUU3 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Sycp2Q9CUU3 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Sycp2Q9CUU3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Sycp2Q9CUU3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Sycp2Q9CUU3 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Sycp2Q9CUU3 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Sycp2Q9CUU3 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Sycp2Q9CUU3 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Sycp2Q9CUU3 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Sycp2Q9CUU3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Sycp2Q9CUU3 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Sycp2Q9CUU3 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Sycp2Q9CUU3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms