Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSB4

Pard3b, Partitioning defective 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard3bQ9CSB4 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pard3bQ9CSB4 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pard3bQ9CSB4 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pard3bQ9CSB4 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pard3bQ9CSB4 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pard3bQ9CSB4 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pard3bQ9CSB4 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pard3bQ9CSB4 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pard3bQ9CSB4 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pard3bQ9CSB4 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pard3bQ9CSB4 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pard3bQ9CSB4 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pard3bQ9CSB4 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pard3bQ9CSB4 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pard3bQ9CSB4 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pard3bQ9CSB4 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pard3bQ9CSB4 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pard3bQ9CSB4 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pard3bQ9CSB4 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pard3bQ9CSB4 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pard3bQ9CSB4 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pard3bQ9CSB4 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pard3bQ9CSB4 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pard3bQ9CSB4 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pard3bQ9CSB4 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pard3bQ9CSB4 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pard3bQ9CSB4 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pard3bQ9CSB4 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pard3bQ9CSB4 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pard3bQ9CSB4 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pard3bQ9CSB4 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pard3bQ9CSB4 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pard3bQ9CSB4 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pard3bQ9CSB4 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pard3bQ9CSB4 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pard3bQ9CSB4 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pard3bQ9CSB4 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pard3bQ9CSB4 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pard3bQ9CSB4 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pard3bQ9CSB4 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pard3bQ9CSB4 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pard3bQ9CSB4 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pard3bQ9CSB4 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pard3bQ9CSB4 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pard3bQ9CSB4 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pard3bQ9CSB4 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pard3bQ9CSB4 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pard3bQ9CSB4 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pard3bQ9CSB4 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pard3bQ9CSB4 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pard3bQ9CSB4 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pard3bQ9CSB4 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pard3bQ9CSB4 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pard3bQ9CSB4 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pard3bQ9CSB4 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pard3bQ9CSB4 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pard3bQ9CSB4 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pard3bQ9CSB4 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pard3bQ9CSB4 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pard3bQ9CSB4 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pard3bQ9CSB4 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pard3bQ9CSB4 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pard3bQ9CSB4 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pard3bQ9CSB4 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pard3bQ9CSB4 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pard3bQ9CSB4 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pard3bQ9CSB4 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pard3bQ9CSB4 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pard3bQ9CSB4 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pard3bQ9CSB4 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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