Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg12Q9CQY1 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms