Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT5

Pomp, Proteasome maturation protein, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PompQ9CQT5 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PompQ9CQT5 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PompQ9CQT5 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PompQ9CQT5 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PompQ9CQT5 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms