Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkp2Q9CQ73 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms