Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpa3Q9CQ71 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.4 ms