Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPU1

Ssxb1, MCG116417, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb1Q9CPU1 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssxb1Q9CPU1 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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