Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL7

Scd3, Acyl-CoA desaturase 3, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd3Q99PL7 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scd3Q99PL7 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scd3Q99PL7 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scd3Q99PL7 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scd3Q99PL7 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scd3Q99PL7 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Scd3Q99PL7 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scd3Q99PL7 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scd3Q99PL7 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scd3Q99PL7 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scd3Q99PL7 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scd3Q99PL7 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scd3Q99PL7 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Scd3Q99PL7 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scd3Q99PL7 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scd3Q99PL7 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scd3Q99PL7 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scd3Q99PL7 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scd3Q99PL7 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scd3Q99PL7 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scd3Q99PL7 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scd3Q99PL7 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Scd3Q99PL7 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Scd3Q99PL7 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Scd3Q99PL7 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scd3Q99PL7 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Scd3Q99PL7 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scd3Q99PL7 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scd3Q99PL7 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scd3Q99PL7 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scd3Q99PL7 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scd3Q99PL7 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scd3Q99PL7 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scd3Q99PL7 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scd3Q99PL7 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scd3Q99PL7 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scd3Q99PL7 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scd3Q99PL7 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scd3Q99PL7 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scd3Q99PL7 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scd3Q99PL7 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scd3Q99PL7 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Scd3Q99PL7 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Scd3Q99PL7 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Scd3Q99PL7 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Scd3Q99PL7 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Scd3Q99PL7 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scd3Q99PL7 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scd3Q99PL7 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scd3Q99PL7 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scd3Q99PL7 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scd3Q99PL7 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scd3Q99PL7 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scd3Q99PL7 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Scd3Q99PL7 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scd3Q99PL7 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scd3Q99PL7 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scd3Q99PL7 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scd3Q99PL7 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scd3Q99PL7 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scd3Q99PL7 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Scd3Q99PL7 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scd3Q99PL7 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scd3Q99PL7 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scd3Q99PL7 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Scd3Q99PL7 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Scd3Q99PL7 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scd3Q99PL7 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Scd3Q99PL7 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scd3Q99PL7 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scd3Q99PL7 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scd3Q99PL7 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scd3Q99PL7 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
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Scd3Q99PL7 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scd3Q99PL7 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scd3Q99PL7 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scd3Q99PL7 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scd3Q99PL7 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scd3Q99PL7 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scd3Q99PL7 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scd3Q99PL7 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scd3Q99PL7 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scd3Q99PL7 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scd3Q99PL7 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scd3Q99PL7 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scd3Q99PL7 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scd3Q99PL7 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scd3Q99PL7 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scd3Q99PL7 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Scd3Q99PL7 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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